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STR有何優(yōu)勢(shì)？中山盛澤親子鑒定中心分享
STR即短串聯(lián)進(jìn)行重復(fù)時(shí)間序列（shorttandemrepeat），也稱微衛(wèi)星DNA（microsatelliteDNA），是以2~6個(gè)堿基可以作為核心工作單位，重復(fù)使用串聯(lián)起來(lái)形成的一類DNA序列。整個(gè)社會(huì)人類通過(guò)基因組中平均每15kb就存在這樣一個(gè)STR，目前已發(fā)現(xiàn)超過(guò)7000個(gè)。由于STR核心技術(shù)單位需要重復(fù)數(shù)目在個(gè)體間呈現(xiàn)一種高度發(fā)展差異性且數(shù)量不斷豐富，構(gòu)成了其遺傳基因多態(tài)性。
STR有何優(yōu)勢(shì)？
STR位點(diǎn)除了具有高度的多態(tài)性外，還具有突變率低、分辨能力強(qiáng)、檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)化容易等優(yōu)點(diǎn)，目前國(guó)際上常用的犯罪DNA數(shù)據(jù)庫(kù)大多以STR位點(diǎn)為基礎(chǔ)。
STR檢測(cè)
目前，熒光標(biāo)記PCR-CE技術(shù)廣泛應(yīng)用于法醫(yī)實(shí)踐，也是STR分型技術(shù)的金標(biāo)準(zhǔn)。PCR-CE技術(shù)分辨率極高，即使核心序列相差一個(gè)重復(fù)，也能成功分型。檢測(cè)結(jié)果分型譜直觀，易于分析。
然而，PCR-CE分析存在一些不可避免的問(wèn)題:
1.PCR-CE技術(shù)只能分析基因序列長(zhǎng)度的多態(tài)性，不能區(qū)分序列中堿基的差異
2.對(duì)于混合檢材分析，不同數(shù)據(jù)來(lái)源檢材含量的比例情況相差較大懸殊時(shí)，PCR-CE往往通過(guò)檢測(cè)不到混合物中量少的檢材；
3.在對(duì)Atlas的分析中，我們經(jīng)常遇到一些影響分類甚至導(dǎo)致錯(cuò)誤分類的情況，例如，錯(cuò)誤命名的等位基因標(biāo)記，錯(cuò)誤識(shí)別的內(nèi)部標(biāo)記，基線的跳躍和擺動(dòng)，結(jié)巴峰，階梯下峰等。
NGS技術(shù)的誕生解決了PCR-CE在STR檢測(cè)中的上述問(wèn)題:
1.NGS在STR分析中更為精確，它能夠準(zhǔn)確地檢測(cè)到DNA序列，并能夠顯示STR等位基因的核心序列和側(cè)翼序列之間的真正差異。通過(guò)NGS測(cè)序，PCR-CE分析發(fā)現(xiàn)同一基因型的STR位點(diǎn)實(shí)際上是不同的基因型。這也表明，如果達(dá)到相同的分辨率，NGS需要更少的基因座;
2.對(duì)于混合檢測(cè)中的痕量樣品，NGS憑借其高通量的特點(diǎn)，通過(guò)對(duì)大量數(shù)據(jù)的處理和分析，可以靈敏地檢測(cè)出痕量樣品的DNA序列；
3.基于自己一份微量檢材的一次進(jìn)行實(shí)驗(yàn)，NGS在獲得STR的同時(shí)，還可以通過(guò)獲得SNP、Indel、mRNA等各種不同類型的大量使用遺傳標(biāo)記數(shù)據(jù)信息，而這是我國(guó)現(xiàn)有一代測(cè)序技術(shù)平臺(tái)所無(wú)法真正做到的。從微量的生物檢材中挖掘出案件所需要的全部遺傳學(xué)相關(guān)信息，這對(duì)于我們實(shí)戰(zhàn)來(lái)說(shuō)就是具有無(wú)可比擬的吸引力。