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STR有何優(yōu)勢？中山盛澤親子鑒定中心分享
STR即短串聯(lián)進行重復(fù)時間序列（shorttandemrepeat），也稱微衛(wèi)星DNA（microsatelliteDNA），是以2~6個堿基可以作為核心工作單位，重復(fù)使用串聯(lián)起來形成的一類DNA序列。整個社會人類通過基因組中平均每15kb就存在這樣一個STR，目前已發(fā)現(xiàn)超過7000個。由于STR核心技術(shù)單位需要重復(fù)數(shù)目在個體間呈現(xiàn)一種高度發(fā)展差異性且數(shù)量不斷豐富，構(gòu)成了其遺傳基因多態(tài)性。
STR有何優(yōu)勢？
STR位點除了具有高度的多態(tài)性外，還具有突變率低、分辨能力強、檢測標(biāo)準(zhǔn)化容易等優(yōu)點，目前國際上常用的犯罪DNA數(shù)據(jù)庫大多以STR位點為基礎(chǔ)。
STR檢測
目前，熒光標(biāo)記PCR-CE技術(shù)廣泛應(yīng)用于法醫(yī)實踐，也是STR分型技術(shù)的金標(biāo)準(zhǔn)。PCR-CE技術(shù)分辨率極高，即使核心序列相差一個重復(fù)，也能成功分型。檢測結(jié)果分型譜直觀，易于分析。
然而，PCR-CE分析存在一些不可避免的問題:
1.PCR-CE技術(shù)只能分析基因序列長度的多態(tài)性，不能區(qū)分序列中堿基的差異
2.對于混合檢材分析，不同數(shù)據(jù)來源檢材含量的比例情況相差較大懸殊時，PCR-CE往往通過檢測不到混合物中量少的檢材；
3.在對Atlas的分析中，我們經(jīng)常遇到一些影響分類甚至導(dǎo)致錯誤分類的情況，例如，錯誤命名的等位基因標(biāo)記，錯誤識別的內(nèi)部標(biāo)記，基線的跳躍和擺動，結(jié)巴峰，階梯下峰等。
NGS技術(shù)的誕生解決了PCR-CE在STR檢測中的上述問題:
1.NGS在STR分析中更為精確，它能夠準(zhǔn)確地檢測到DNA序列，并能夠顯示STR等位基因的核心序列和側(cè)翼序列之間的真正差異。通過NGS測序，PCR-CE分析發(fā)現(xiàn)同一基因型的STR位點實際上是不同的基因型。這也表明，如果達到相同的分辨率，NGS需要更少的基因座;
2.對于混合檢測中的痕量樣品，NGS憑借其高通量的特點，通過對大量數(shù)據(jù)的處理和分析，可以靈敏地檢測出痕量樣品的DNA序列；
3.基于自己一份微量檢材的一次進行實驗，NGS在獲得STR的同時，還可以通過獲得SNP、Indel、mRNA等各種不同類型的大量使用遺傳標(biāo)記數(shù)據(jù)信息，而這是我國現(xiàn)有一代測序技術(shù)平臺所無法真正做到的。從微量的生物檢材中挖掘出案件所需要的全部遺傳學(xué)相關(guān)信息，這對于我們實戰(zhàn)來說就是具有無可比擬的吸引力。